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匡汉晖

匡汉晖博士

教授,博士生导师,长江学者特聘教授,园艺植物生物学教育部重点实验室常务副主任
华中农业大学园艺林学学院蔬菜系,湖北,武汉,430070
联系电话:027-87280752
Email:kuangfile@gmail.com

 

个人简介:1988年毕业于江西农业大学获学士学位;1991年毕业于北京林业大学获硕士学位;1994-1998年在美国佐治亚大学(University of Georgia)学习,获博士学位。博士毕业后于1998-2007年分别在以色列海法大学(University of Haifa)、美国加州大学戴维斯分校(University of California, Davis)和伯克莱分校(University of California, Berkeley)从事蔬菜抗病研究工作。2008年受聘为长江学者特聘教授,现为华中农业大学园艺林学学院蔬菜系教授,博士生导师。

 

主讲课程:植物基因组学

 

研究方向:植物抗病与分子进化


研究工作:课题组的主要研究方向是茄科蔬菜中的抗病基因,内容包括抗病基因(NBS-LRR)的生物信息学、遗传定位及克隆、分子进化、比较基因组学、功能基因组学。具体研究课题为:

  1. 基因组学:利用生物信息学方法分析烟草、西红柿和土豆基因组中的所有NBS-LRR基因。对这些抗病基因进行遗传定位、比较基因组学和分子进化的研究。利用实验手段了解抗病基因进化的规律。
  2. 抗病基因快速克隆方法的建立:通过对抗病基因的序列分析,找出抗病基因的保守序列,设计几个人工微RNA用以沉默大部分NBS-LRR基因,同时设计一套VIGS沉默载体沉默基因组中的绝大多数抗病基因。这套分析系统将极大提高植物抗性的遗传鉴定,加快抗病基因的克隆,尤其是QTL抗病基因和抗虫基因的克隆。这套系统将首先在烟草中进行,试验成功后再推广到其它蔬菜和农作物上。我们同时利用第二代高通量测序技术来快速定位和克隆基因。以上技术成熟后将应用到番茄青枯病和黄化曲叶病的抗性资源筛选和抗性基因克隆中。
  3. 烟草与TMV的相互作用。烟草属对TMV抗性的进化;不同野生烟草对TMV抗性的分子机理;用实验的方法了解抗病基因N的突变规律;TMV接种后无症状性状的遗传和分子机制。


代表性论文:

  1. Chen, J., Hu, Q., Zhang, Y., Lu, C., Kuang, H. (2013) P-MITE: a database for plant miniature inverted-repeat transposable elements. Nucleic Acids Res doi: 10.1093/nar/gkt1000
  2. Lin, X., Zhang, Y., Kuang, H., Chen, J. (2013) Frequent loss of lineages and deficient duplications accounted for low copy number of disease resistance genes in Cucurbitaceae. BMC Genomics 14:335
  3. Jia et al., (2013) Aegilops tauschii draft genome sequence reveals a gene repertoire for wheat adaptation. Nature, 496:91-5
  4. Guo et al., (2012) The draft genome of watermelon (Citrullus lanatus) and resequencing of 20 diverse accessions. Nat Genet. 45(1):51-8.
  5. Xu et al., (2012) The draft genome of sweet orange (Citrus sinensis). Nat Genet. 16;45(1):59-66.
  6. Yin, L.F., Hu, M.J,, Wang, F., Kuang, H., Zhang, Y., Schnabel, G., Li, G.Q., Luo, C.X. (2012) Frequent gain and loss of introns in fungal cytochrome B genes. PLoS One. 7 (11)
  7. Chen, J., Lu, C., Zhang, Y., Kuang H. (2012) Miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs) in rice were originated and amplified predominantly after the divergence of Oryza and Brachypodium and contributed considerable diversity to the species. Mob Genet Elements. 2(3):127-132.
  8. Luo, S., Zhang, Y., Hu, Q., Chen, J., Li, Q., Lu, C., Liu, H., Wang, W., Kuang, H. (2012) Dynamic nucleotide-binding-site and leucine-rich-repeat-encoding genes in the grass family. Plant Physiol, 159:197-210
  9. Lu, C., Chen, J., Zhang, Y., Hu, Q., Su, W., Kuang H. (2012) Miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs) have been accumulated through amplification bursts and play important roles in gene expression and species diversity in Oryza sativa. Mol Bio Evol, 29:1005-1017
  10. Li G., Huang S., Guo X., Li Y., Yang Y., Guo Z., Kuang H., Rietman H., Bergervoet M., Vleeshouwers V., van der Vossen EA., Qu D., Visser R., Jacobsen E., Vossen J. (2011) Cloning and characterization of R3b; Members of the R3 superfamily of late blight resistance genes show sequence and functional divergence. Mol Plant Microbe Interact, 24:1132-1142

 
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