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陈炯炯

 

陈炯炯博士

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个人简介:

   华中农业学院园艺林学学院蔬菜系副教授,硕士生导师,园艺植物生物学教育部重点实验室研究人员。博士期间主要从事与生殖相关的S5基因的克隆以及功能分析,并对该基因编码的天冬氨酸蛋白酶家族的起源进化进行了详细分析。相关工作以第一作者发表在PNASGene杂志上。目前,主要从事植物分子进化研究,研究内容包括抗病基因进化及功能分析;微型反向转座子(MITE)进化、起源,及其对植物基因和基因组进化的影响;生菜叶型发育及进化分析。相关工作以第一作者或通讯作者发表在Mol Biol EvolNucleic Acids Res BMC Genomics等影响因子较高的杂志上。未来的研究工作将集中在人工选择对生菜/莴笋株型、叶型的影响及其遗传和分子机理。为了以后系统进行叶型发育和进化的研究,20135月至20145月美国加州大学伯克利分校从事一年叶发育相关研究


研究方向:植物基因组中微型方向转座子起源、进化及对基因表达影响;生菜叶形发育遗传分子机理

承担的科研项目:
主持国家自然科学基金青年科学基金项目,湖北省自然科学基金一般项目,教育部新教师基金一项,华中农业大学自主科技创新基金基础研究专项自由探索类项目,中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室开放课题,第47批中博士后科学基金一项

代表性论文:
1. Chen J, Hu Q, Zhang Y, Lu C, Kuang H. P-MITE: a database for plant miniature inverted-repeat transposable elements. Nucleic Acids Res. 2013 Oct 29. (IF=8.27)

2. Lin X, Zhang Y, Kuang H, Chen J. Frequent loss of lineages and deficient duplications accounted for low copy number of disease resistance genes in Cucurbitaceae. BMC Genomics. 2013 May 17;14:335. (Corresponding author) (IF=4.40)

3. Lu C, Chen J, Zhang Y, Hu Q, Su W, Kuang H. Miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs) have been accumulated through amplification bursts and play important roles in gene expression and species diversity in Oryza sativa. Mol Biol Evol. 2012 Mar;29(3):1005-17. (co-first author) (IF=10.353)

4. Chen J, Ouyang Y, Wang L, Xie W, Zhang Q. Aspartic proteases gene family in rice: Gene structure and expression, predicted protein features and phylogenetic relation. Gene. 2009 Aug 1;442(1-2):108-18. (IF= 2.416)

5. Chen J, Ding J, Ouyang Y, Du H, Yang J, Cheng K, Zhao J, Qiu S, Zhang X, Yao J, Liu K, Wang L, Xu C, Li X, Xue Y, Xia M, Ji Q, Lu J, Xu M, Zhang Q. A triallelic system of S5 is a major regulator of the reproductive barrier and compatibility of indica-japonica hybrids in rice. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Aug 12;105(32):11436-41.(IF=9.38)

6. Chen J, Lu C, Zhang Y, Kuang H*. Miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs) in rice were originated and amplified predominantly after the divergence of Oryza and Brachypodium and contributed considerable diversity to the species. Mobile Genetic Elements, 2(3), 1-6, 2012.

7. Yang J, Zhao X, Cheng K, Du H, Ouyang Y, Chen J, Qiu S, Huang J, Jiang Y, Jiang L, Ding J, Wang J, Xu C, Li X, Zhang Q. A killer-protector system regulates both hybrid sterility and segregation distortion in rice. Science. 2012 Sep 14;337(6100):1336-40. (IF=31.03)

8. Xu Q, Chen LL, Ruan X, Chen D, Zhu A, Chen C, Bertrand D, Jiao WB, Hao BH, Lyon MP, Chen J, Gao S, Xing F, Lan H, Chang JW, Ge X, Lei Y, Hu Q, Miao Y, Wang L, Xiao S, Biswas MK, Zeng W, Guo F, Cao H, Yang X, Xu XW, Cheng YJ, Xu J, Liu JH, Luo OJ, Tang Z, Guo WW, Kuang H, Zhang HY, Roose ML, Nagarajan N, Deng XX*, Ruan Y*. The draft genome of sweet orange (Citrus sinensis). Nat Genet. 45(1), 59-66, 2013. (IF=35.21)

9. Luo S, Zhang Y, Hu Q, Chen J, Li K, Lu C, Liu H, Wang W, Kuang H.Dynamic nucleotide-binding site and leucine-rich repeat-encoding genes in the grass family. Plant Physiol. 2012 May;159(1):197-210. (IF=6.55)

10. Ouyang Y, Chen J, Xie W, Wang L, Zhang Q. Comprehensive sequence and expression profile analysis of Hsp20 gene family in rice. Plant Mol Biol. 70(3), 341-357, 2009. (IF=3.51)

 
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